Как сообщалось в пояснительной записке к законопроекту, функционирование Следственного комитета вне системы прокуратуры создаст необходимые условия для более эффективной работы.
Идея вовсе не была новой: отделить СК от других структур решил впервые Петр I. Император осуществил судебную реформу, разделив уголовный процесс на две стадии: предварительное расследование и судебное разбирательство.
В 1713 году в России появились первые специализированные следственные органы. Ими стали майорские следственные канцелярии, которые подчинялись императору. При этом следственные органы, зависимые только от Петра, могли оставаться беспристрастными
После смерти великого императора независимые следственные органы упразднили, а предварительное следствие стали рассматривать как рядовую процессуальную процедуру досудебного производства.
С 1723 до 1860 года расследованием преступлений занимались неспециализированные органы: полицмейстерская канцелярия, сыскной приказ, нижние земские суды, управы благочиния.
После 1917 года следственные подразделения появились практически при всех правоохранительных органах. Уже в 1927 году в Московской губернии судебных следователей перевели в органы прокуратуры.
В 1963 году следственные органы появились и в Министерстве охраны общественного порядка (позже оно стало именоваться Министерством внутренних дел). В 2007 году Следственный комитет при прокуратуре РФ стал относительно самостоятельным ведомством, однако все еще входил в систему органов прокуратуры.
Закон 2011 года вернул модель развития следственных органов к идее Петра I. Теперь руководить комитетом может только глава государства. Сейчас СК РФ не входит в структуру ни одного из органов государственной власти.