В феврале 1992 года в составе МВД России было создано Главное управление по экономическим преступлениям (ГУЭП), которое спустя пять лет было переименовано в ГУБЭП — Главное управление по борьбе с экономическими преступлениями. Уже в июне 2001 года оно вошло в состав Службы криминальной милиции МВД России, а через два года в структуре министерства начала действовать Федеральная служба по экономическим и налоговым преступлениям.
В результате административной реформы она стала Департаментом экономической безопасности (ДЭБ). В 2011 году указом Президента ДЭБ переименовали в Главное управление экономической безопасности и противодействия коррупции (ГУЭБиПК) МВД России.
Сегодня ГУЭБиПК — самостоятельное структурное подразделение центрального аппарата МВД России.